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投票标题: 第一性原理程序使用频度统计(2021) (多选)

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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

[交流] 第一性原理程序使用频度统计(2021)

论坛内上一次统计这个问题可能是在2014年,时隔多年,有更多的程序可以被用于模拟研究供大家选择。本次统计原则上只包含Kohn-Sham框架下的求解引擎,半经验方法和激发态处理如DFTB和BGW等暂时不计入其中,其他的前后处理接口程序和图形显示程序如ASE和XCrysDen也不包含,更多没有被包含的程序大家也可以补充在帖子中。本次统计的目的是为了能够让大家更方便交流以及认识不同程序擅长解决的问题、算法上的优势,也欢迎跟帖交流讨论。
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
7楼: Originally posted by 泡泡媛 at 2021-06-10 12:15:09
很可惜现在小木虫的热度已经远远低于隔壁计算化学公社了,也不见大佬们讨论一些热点问题了,太可惜了。我觉得可能需要新的开源社区取而代之了。
自打我做计算以来,一直接触的都是大体系,一般都是200个原子以上, ...

CP2K功能是很多,MD的算法也不错。但是SCF相关算法稳健性太差了,体验做不上去,赝势和基组的精度也不大行。这点官方的测试我也看了一些,随基组增加总体精度是更接近全电子的结果了,但是相同赝势下基组极限偏离Abinit,显得十分奇怪。

至于开源/免费还是商业,我个人看法是,你看前面哪些体验的问题、还有一些参数优化的问题、算法的稳健性,甚至是代码效率的问题,都是需要巨大的人力物力的,开发者也要养家糊口,光靠一腔情怀很难让大家有长期的动力。要找个平衡的话,学术免费、商业/工业收费也许还是比较可取的。另外商业和开源不冲突,参考VASP。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

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10楼2021-08-02 11:58:21
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

迄今,我个人最常使用的主要还是Quantum Espresso(QE)、DMol3。

QE的主要模块pw.x是基于赝势平面波框架的程序,赝势支持PSLib的超软赝势和PAW、GBRV超软赝势、ONCV框架的SG15和Dojo模守恒赝势,这些赝势的精度相对而言都比较高,QE允许这些赝势/PAW混合使用。QE处理二维体系比较友好,对于边界处理,外加电荷或者表面存在偶极矩的情况有专门的修正方法,也支持恒Fermi能级的计算。Hubbard模型支持各向同性的DFT+Ueff以及非各项同性的DFT+U+J以及考虑位点间排斥的DFT+U+V模型。后处理分析中支持RDG和ELF等(6.7之前的某些版本可能有bug,我和朋友已经向官方提交了修正版本),还有DFPT支持多q点计算声子谱。缺点当然也有,比如算法比较单一,迭代算法中可调的参数比较少,部分功能可能只支持模守恒赝势(如MetaGGA),溶剂化插件Environ相对来说也不那么好用,经常跟不上版本。

平面波基组尺寸要比原子轨道基组大很多,稍大一些尺寸的体系还是LCAO更快。不管原子相同不相同,或者这个位置有没有原子,平面波方法都一视同仁加上等间距的积分网格,比如表面上吸附个长链的分子或者纳米线亦或是分子的积分平面波效率要低很多。
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2楼2021-05-01 08:39:06
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涪东耳

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
居然只有我一个用全势方法,难以置信。

发自小木虫Android客户端
3楼2021-05-24 03:08:20
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
3楼: Originally posted by 涪东耳 at 2021-05-24 03:08:20
居然只有我一个用全势方法,难以置信。

应该不会,ELK我也用过一段时间,不过现在折腾偏少。
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4楼2021-06-04 19:41:05
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