第一性原理程序使用频度统计（2021） - 第一性原理 - 热点前沿问题讨论

yimin

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电催化计算初学者，用的主要是VASP,最新准备开始学习JDFTx,有大佬是用这个的吗？求带

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12楼2022-04-15 17:40:35

rlafite

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7楼: Originally posted by 泡泡媛 at 2021-06-10 12:15:09
很可惜现在小木虫的热度已经远远低于隔壁计算化学公社了，也不见大佬们讨论一些热点问题了，太可惜了。我觉得可能需要新的开源社区取而代之了。
自打我做计算以来，一直接触的都是大体系，一般都是200个原子以上， ...

既然你“对平面波基组的软件没啥好感”，我建议你转到基于Green Function的多重散射KKR的方法来

13楼2022-09-05 04:46:11

卡开发发

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13楼: Originally posted by rlafite at 2022-09-05 04:46:11
既然你“对平面波基组的软件没啥好感”，我建议你转到基于Green Function的多重散射KKR的方法来...

KKR在第一原理这块可能用的并不是那么多了，MTO基组的积分不是一点点繁琐，复杂一点比如杂化泛函这些处理起来就不是太容易了。

不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎发帖或留言。

14楼2022-09-06 20:36:43

匿名

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15楼2023-04-28 11:08:18

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16楼2023-08-16 15:05:49

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计算大体系，我推荐LSMS KKR，可以算10万以上的原子体系（100,000atoms）
Locally Self-consistent Multiple Scattering (LSMS) code
https://www.sciencedirect.com/sc ... i/S0010465516301953
https://github.com/mstsuite/MuST/tree/master/lsms

17楼2023-12-01 00:35:58

wangyikeco

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6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2021-06-08 23:31:54
这倒是，矩阵元的处理太复杂了。...

KKR矩阵元是对角线上稀疏矩阵元，可以分割成很多小矩阵元，能在GPU里轻松处理上10万个原子的体系
，矩阵元的处理已经不复杂了。
recommend you the following article:
GPU acceleration of the Locally Self-consistent Multiple Scattering code for first principles calculation of the ground state and statistical physics of materials
Computer Physics Communications
Markus Eisenbach a, Jeff Larkin b, Justin Lutjens b, Steven Rennich b, James H. Rogers a
Volume 211, February 2017, Pages 2-7

18楼2023-12-01 01:49:02

卡开发发

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18楼: Originally posted by wangyikeco at 2023-12-01 01:49:02
KKR矩阵元是对角线上稀疏矩阵元，可以分割成很多小矩阵元，能在GPU里轻松处理上10万个原子的体系
，矩阵元的处理已经不复杂了。
recommend you the following article:
GPU acceleration of the Locally Self-c ...

其他贴给过您答复，这里只是再拿出来说一遍，例如做杂化泛函、post-hf等，其中四中心积分还是非常复杂的，局域基组如果没有巧妙的办法处理这种积分效率将会比较低下，对KKR或者LMTO通常是要在ASA下面完成的。

这里文章我细看了一下其实还是在MTA上的，当然对线性标度方法确实不能要求太多。如果单从作为一个模拟软件来说，结构优化（也就是获得对核坐标梯度，应变梯度）是否能够进行等等一系列问题也都很重要。

有关于其他高（基组）精度的大规模方法你有兴趣可以参考这个https://dl.acm.org/doi/pdf/10.1145/3581784.3627037。当然，Gordon-Bell prize里面线性标度程序也有专门测试，这里不过多详述。

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19楼2023-12-01 21:59:19

泡泡媛

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17楼: Originally posted by wangyikeco at 2023-12-01 00:35:58
计算大体系，我推荐LSMS KKR，可以算10万以上的原子体系（100,000atoms）
Locally Self-consistent Multiple Scattering (LSMS) code
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0010465516301953
ht ...

好的，有时间我看下，笑死，这个帖子已经是两年前了

20楼2023-12-09 15:39:11