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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » QE-ralex计算耗时过高求助
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849621108

新虫 (小有名气)

[求助] QE-ralex计算耗时过高求助

各位老师好，本人用QE对Fe（110）表面吸附胆碱分子（共57个原子）进行优化耗时过高已算18小时（36核机子，指定24核进行计算）先前已搭建2层Fe（110）进行优化计算，5小时就能算完，结果收敛。不明白为什么加了几个分子就算的这么费劲了，还请大家帮忙分析指出问题
1. 输入文件是否需要修改，萌新一枚还需要多多学习
2. 关于K点的设置一直不明白该如何设置，本人只想优化后进行自洽计算，得到分子和表面的结合能
3. 看结果已经得到 ！total energy =   ，为何又进行了几次计算，一直没结束   

输入文件如下：
&CONTROL
    calculation   = "relax"
    forc_conv_thr =  1.00000e-03
    max_seconds   =  1.72800e+05
    nstep         = 100
    outdir        = "./out/"
    prefix        = "Fe"
    pseudo_dir    = "./pseudo/"
/

&SYSTEM
    a                         =  8.54435e+00
    b                         =  1.20835e+01
    c                         =  2.20139e+01
    degauss                   =  1.00000e-02
    ecutrho                   =  7.20000e+02
    ecutwfc                   =  7.10000e+01
    ibrav                     = 8
    nat                       = 57
    nbnd                      = 560
    nspin                     = 2
    ntyp                      = 5
    occupations               = "smearing"
    smearing                  = "gaussian"
    starting_magnetization(1) =  2.00000e-01
/

&ELECTRONS
    conv_thr         =  1.00000e-06
    electron_maxstep = 200
    mixing_beta      =  4.00000e-01
    startingpot      = "atomic"
    startingwfc      = "atomic+random"
/

&IONS
    ion_dynamics = "bfgs"
/

&CELL
/

K_POINTS {gamma}

ATOMIC_SPECIES
Fe     55.84500  Fe.pbe-spn-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
C      12.01070  C.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
O      15.99940  O.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
H       1.00794  H.pbe-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
N      14.00674  N.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF

ATOMIC_POSITIONS {angstrom}
Fe      1.424026   0.000000   3.199978
Fe      0.000000   2.013858   3.199969
Fe      0.000000   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      1.424028   4.027940   3.199913
Fe      0.000000   6.041766   3.199919
Fe      0.000000   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      1.424028   8.055592   3.199913
Fe      0.000000  10.069675   3.199969
Fe      0.000000   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058  10.069611   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   0.000000   3.199966
Fe      2.848090   2.013858   3.199947
Fe      2.848116   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   4.027940   3.199908
Fe      2.848090   6.041766   3.199903
Fe      2.848116   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   8.055592   3.199908
Fe      2.848090  10.069675   3.199947
Fe      2.848116   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174  10.069611   1.281726  0 0 0
Fe      7.120322   0.000000   3.199978
Fe      5.696258   2.013858   3.199947
Fe      5.696232   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      7.120320   4.027940   3.199913
Fe      5.696258   6.041766   3.199903
Fe      5.696232   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      7.120320   8.055592   3.199913
Fe      5.696258  10.069675   3.199947
Fe      5.696232   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290  10.069611   1.281726  0 0 0
N       5.207106   6.379566   9.490652
C       4.458808   5.274458   8.788986
H       4.466925   5.504868   7.722789
H       5.027292   4.356460   8.939624
C       5.344448   6.105289  10.970915
H       5.871006   6.956905  11.405325
H       4.352568   6.009537  11.406872
H       5.934319   5.200383  11.106221
C       4.542290   7.719280   9.299953
H       3.583093   7.721465   9.812374
H       5.197316   8.476850   9.734927
H       4.399315   7.890241   8.233444
C       6.592575   6.454392   8.891952
H       6.498674   6.693765   7.833590
H       7.072934   5.487661   9.021847
H       7.378590   7.242216   9.160463
C       3.015406   5.040035   9.222742
H       2.962920   4.724101  10.270916
H       2.410084   5.946501   9.101761
O       2.572384   4.009714   8.353457
H       1.673974   3.758595   8.592521
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1楼2020-09-04 08:33:58
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akakcolin

金虫 (著名写手)
你的体系原子比较少，应该用较少的核，比如8核跑 就会快，猜测不一定对，您可以尝试下
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为人应当诚实正直不能心怀叵测心眼明亮才能迎来幸福避开灾祸盲目者若有人指点才不会迷失道路若单独上路就难以保证不误入岐途
2楼2021-09-12 21:35:28
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读不下去就run

新虫 (初入文坛)
打乱对称性了，算得慢很正常，本来优化就是一点一点优化的。

发自小木虫IOS客户端
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3楼2024-04-24 23:00:46
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